קבוצת העבודה קיימה שלוש ישיבות במהלך תקופת הביניים בין ישיבות הוועידה (מינואר עד נובמבר 2025). מרוקו, בתפקידה כנשיאת הישיבה השישית של הוועידה, עמדה בראש כל ישיבות קבוצת העבודה . 

בישיבתה הראשונה, שהתקיימה בניו יורק ב-21 בינואר 2025, קבוצת העבודה דנה בהיבטים הארגוניים של עבודתה. הוחלט כי שתי ישיבות מהותיות יתקיימו במרץ ובמאי 2025 כדי לדון בשלושת הנושאים שעליהם הוסכם (ערבויות ביטחון שליליות (negative security assurances); מנגנוני שיתוף פעולה, התייעצות והבהרה ויישוב סכסוכים; וקידום שיתוף הפעולה בין אזורים חופשיים מנשק גרעיני לבין ועידת המזרח התיכון), ולפעול על פי הפורמט של פגישות קודמות של קבוצת העבודה עם מצגות על ידי מומחים מוזמנים, ולאחריהן דיונים אינטראקטיביים בין חברי הוועידה עם המומחים. 

במהלך המפגש השני של קבוצת העבודה שהתקיים בניו יורק  19-21 מרץ 2025, חברי הוועידה דנו בשני הנושאים שעליהם הוסכם: (א) ערבויות ביטחון שליליות (NSA) ו-(ב) שיתוף פעולה, התייעצות והבהרה, ויישוב סכסוכים, עם מצגות של מומחים מוזמנים. סיכום הדיונים מצורף לדו"ח הסופי של הישיבה השישית. 

הישיבה השלישית של קבוצת העבודה התקיימה  12-14 מאי 2025 בעמאן, ירדן. קבוצת העבודה דנה בנושאים שעליהם הוסכם בנוגע לקידום שיתוף הפעולה בין אזורים חופשיים מנשק גרעיני לבין ועידת המזרח התיכון, עם מצגות של נציגי מדינות חברות ומזכירויות של אזורים חופשיים מנשק גרעיני, כמו גם מומחים מארגונים באזור שהוזמנו לישיבה. התוכנית כללה גם ביקור במאיץ אור למדע יישומי וניסויים במזרח התיכון (SESAME) בסאלט, ירדן. 

סיכום קבוצת העובודה צורף לדו"ח של הישיבה השישית של הוועידה וכולל מידע על הישיבות, המומחים המוזמנים, ונקודות עיקריות מהדיונים.