במהלך המושב השני, הוועידה לפירוז המזרח התיכון מנשק גרעיני ומנשק להשמדה המונית אימצה החלטה להקים - על בסיס לא פורמלי - ועדת עבודה שתמשיך את הדיון בנושאים הקשורים למנדט של הוועידה ) החלטת האסיפה הכללית  של האו"ם 73/546(, על פי התוצאות שכל מושב שנתי של הוועידה.

ועדת העבודה קיימה שלוש פגישות בין המושב השני שהתקיים בנובמבר 2021 למושב השלישי שהתקיים בנובמבר 2022. כווית, כנשיאת המושב השני של הוועידה, כיהנה כנשיאת כל הישיבות של ועדת העבודה.

הפגישה הראשונה של ועדת העבודה נערכה ב-24 במרץ 2022 במטה האו"ם בניו יורק. בפגישה הוחלט על ההיבטים הארגוניים של הועדה והוסכם לקיים שתי ישיבות נוספות לפני המושב השלישי של הוועידה, בנובמבר 2022.

בתאריכים 7-9 ביוני, הישיבה השנייה של ועדת העבודה, שהייתה הישיבה התמטית הראשונה שלה, קיימה דיון נושאי במטה האו"ם בניו יורק. הדיון  התקיים על בסיס נייר "חומר למחשבה" בלתי פורמלי שהופץ ע"י נשיא הוועידה. הנייר הכיל רעיונות לדיון בשבעת הנושאים שצוינו בדו"ח של המושב השני כטעונים דיון נוסף:

(א) הצטרפות של חברי הוועידה לאמנות רב-צדדיות בנושאי נשק להשמדה המונית;

(ב) תנאים לכניסת האמנה לתוקף;

(ג) מנגנון אימות לנשק ביולוגי;

(ד) אמצעי אימות אחרים והפרוטוקול הנוסף להסכמי הפיקוח בין מדינות והסוכנות הבינלאומית לאנרגיה אטומית;

(ה) אמצעי כפייה חד-צדדיים;

(ו) מזכירות האמנה;

(ז) היכן האמנה תופקד.

באותה פגישה הסכימו המשתתפים לקיים במפגש השלישי של ועדת העבודה דיונים נוספים בצורה לא פורמלית ומעמיקה בשני נושאים מרכזיים, "היבטים משפטיים של האמנה העתידית של אזור המזרח התיכון" (הובן שהנושא יכלול גם כן סוגיות כגון הצטרפות להסכמי נשק להשמדה המונית אחרים), ו"אימות נשק גרעיני" עם חוות דעת של מומחים מוזמנים. צוינה רשימה ראשונית של מומחים שהציעה המזכירות, והוסכם כי חברי הוועידה (שהן מדינות ערב, איראן וישראל) יוסיפו לרשימה מומחים לאומיים נוספים.

בין התאריכים 6-8 בספטמבר 2022, התקיימה הפגישה השלישית של ועדת העבודה באחוזת Tarrytown House, בניו יורק. במהלך פגישה זו, הוזמנו מומחים להציג על "ההיבטים המשפטיים של האמנה העתידית של פירוז המזרח התיכון מנשק גרעיני ומנשק להשמדה המונית" ו"אימות ביחס לנשק גרעיני".

בעקבות המצגות, נציגי החברים בוועידה דנו אינטראקטיבית עם המומחים בנושאים מרכזיים אלו.

סיכום עבודת ועדת העבודה נכלל כנספח לדוח המושב השלישי של הוועידה. מלבד פירוט שמות המומחים המוזמנים והנושאים שבהם דיברו, הסיכום כלל רק מידע כללי על התאריכים והתנהלות הפגישה אך לא שיקף את הדיונים המהותיים בין המדינות.