طی جلسۀ دوم کنفرانس ایجاد خاورمیانۀ عاری از سلاح هسته‌ای و دیگر جنگ‌افزارهای کشتارجمعی تصمیم غیررسمی مبنی بر ایجاد کمیتۀ کاری اتخاذ شد. این کمیته مسپولیت پیگیری و بررسی مسائل مربوط به دستورکار کنفرانس که در تصمیم 546/73 مجمع عمومی آمده است و مطابق با نتایج هریک از جلسات سالانۀ تعیین می شودرا برعهده دارد. 

کمیتۀ کاری سه جلسه   مابین نوامبر 2021 (کنفرانس دوم) و نوامبر 2022 (کنفرانس سوم)  و در فاصله میان برگزاری دو کنفرانس  برگزار کرد. این جلسات به ریاست رئیس دومین جلسۀ کنفرانس، کویت، برگزار شدند. 

نخستین جلسه در 24 مارس 2022 در مقر سازمان ملل متحد در نیویورک برگزار شد و در آن ابعاد تشکیلاتی کمیتۀ کاری مورد بررسی قرار گرفت. تصمیم به برگزاری دو جلسۀ دیگر پیش از آغاز کنفرانس سوم از دیگر نتایج این جلسه بود.  

دومین جلسۀ کمیتۀ کاری کنفرانس که درحقیقت اولین جلسۀ محتوایی آن بود، با بررسی‌های موضوعی بین 7 تا 9 ژوئن 2022 در مقر سازمان ملل متحد در نیویورک برگزار شد. موضوعات مورد بررسی، هفت موضوعی بودند که در گزارش جلسۀ دوم کنفرانس ذکر شدند و نیازمند بررسی بیشتر بودند. این موضوعات توسط رئیس جلسه در سندی غیررسمی  حاوی ایده‌هایی برای بررسی نمایندگان جمع آوری  و جلسه بر پایۀ آن صورت پذیرفت. این موضوعات عبارتند از:  

(الف) پیوستن کشورهای عضو کنفرانس به اسناد حقوقی چندجانبۀ مرتبط با تسلیحات کشتار جمعی 

(ب) شرایط به اجرا درآمدن معاهده 

(پ) سازکارهای راستی آزمایی در حوزۀ تسلیحات بیولوژیکی 

(ت) دیگر اقدامات راستی آزمایی و پروتکل الحاقی معاهدۀ پادمان بین کشورها و آژانس بین‌المللی انرژی اتمی  

(ث) اقدامات قهری یکجانبه 

(ج) دبیرخانۀ معاهده 

(چ) امین معاهده 

در دومین جلسۀ کنفرانس ایجاد خاورمیانۀ عاری از تسلیحات هسته ای و دیگر جنگ‌افزارهای کشتار جمعی، شرکت کنندگان با برگزاری جلسۀ سومی جهت انجام گفتگوهای غیررسمی و عمیق بیشتر همراه با شنیدن نظرات کارشناسان پیرامون دو موضوع کلیدی یعنی «ابعاد حقوقی معاهدۀ منطقۀ عاری از سلاح‌های هسته‌ای و دیگر تسلیحات کشتار جمعی در خاورمیانه در آینده» (که دربرگیرندۀ موضوعات مربوط به الحاق به دیگر معاهدات سلاح‌های کشتارجمعی نیز می‌باشد) و «راستی آزمایی تسلیحات هسته‌ای» موافقت کردند. لیست اولیۀ کارشناسانی که توسط دبیرخانه پیشنهاد شدند مطرح و موافقت شد که اعضای کنفرانس (تمامی کشورهای عربی، ایران و اسرائیل) لیست را با معرفی کارشناسانی از کشورهای خود تکمیل کنند. 

کمیتۀ کاری سومین جلسۀ خود را در هتل تاریتون هاوس استیت در نیویورک برگزار کرد. در طول این جلسه، کارشناسان مدعو نظرات خود را درخصوص دو موضوع ابعاد حقوقی معاهدۀ منطقۀ عاری از سلاح‌های هسته‌ای و دیگر تسلیحات کشتار جمعی در خاورمیانه در آینده و راستی آزمایی تسلیحات هسته‌ای ارائه دادند. 

جلسه با گفتگو و تعامل نمایندگان کشورهای شرکت کننده در کنفرانس و کارشناسان درخصوص این دو موضوع کلیدی ادامه یافت.  

خلاصه‌ای از اقدامات کمیتۀ کاری در قالب پیوست در گزارش سومین جلسۀ کنفرانس آمده است. این خلاصه تنها دربردارندۀ لیستی از اسامی کارشناسان مدعو به کنفرانس، موضوعات در دستورکار جلسه و تاریخ و نحوۀ برگزاری جلسات است و در آن اشاره‌ای به گفتگوهای موضوعی بین نمایندگان کشورها نشده است.